玩家开始游戏后就能在地图上发现部分独立势力的部队,有些独立势力天然跟玩家敌对,敌对独立势力会自己生产部队并开始在地图上游荡,如果发现有任何一个定居点防备比较薄弱,它们会立刻突袭定居点的市中心并将此处夷为平地。天然友好的独立势力所产生的军事单位只会用来自保,并不会进入到玩家的领土范围之内,判断独立势力是否友好的方式是查看其部队和老巢的外围光环就行,如果光环是红色就表示这个是带有敌意的独立势力。
所有独立势力都能通过影响力来对其进行渗透,可以支付一小部分的影响力让独立势力去攻击其它的文明,也能支付大量外交影响力去同化一个独立势力。若一个独立势力的态度本来就很友好,在标准游戏速度下只需要在花费影响力后等待十五个回合,它就会变成附属城邦。若该城邦本来就处于敌对状态,玩家要先额外花费十五个回合拉近关系,然后才能再花费十五个回合将其彻底收服。
其它文明同样会拉拢独立势力,想成为独立势力的宗主国需要先走完其融合的进度条,收服独立势力后无法再被拉拢,拉拢过程中可以支付额外影响力加快融合进度,在标准速度下每加速一回合就要多付出一百点影响力。独立势力拥有科技、经济、文化和军事四大类型,剿灭其老巢的产出分别对应了科技点数、文化点数、金钱以及生产力四种资源。