在游戏中队伍里能携带的帕鲁是有上限的,而在仓库内储存的帕鲁也是有上限的,不能无限制的去捕捉帕鲁。处理这些多出来的帕鲁,最直接的方法就是选择将其放生,在仓库中选择一些没用的帕鲁将其放生,就能空出仓库的位置。但直接放生是没有任何收益的,这会浪费捕捉这只帕鲁的材料。可以选择拿去卖掉,在地图中存在一些聚落,过来后在里面能找到帕鲁商人。
在这个帕鲁商人这里能购买到帕鲁,同时也能选择卖掉自己有的帕鲁,在仓库里的帕鲁也都能直接在这里卖掉。这里的商人虽然卖的帕鲁每次都不一样的,但是所有帕鲁都是收的,所以可以在这里随意的卖掉帕鲁。在游戏中可捕捉一些npc,这些npc被捕捉后也会占仓库位置,这个普通的帕鲁商人这里是不能出售这些npc的,需要找到穿黑衣的帕鲁商人,才能将这些npc卖掉,而且卖的价格还比较高。
如果有多只同样的帕鲁,还可以选择直接用来强化,在升到十四级之后,在科技列表会解锁一个名为科技帕鲁浓缩机的装置,这个装置就能将同类型的帕鲁浓缩。浓缩还会随等级增加,越到后面需要的数量就越多,这点也是能很快清理多余帕鲁的方法,而且还不会亏损经济。还有方法就是将这些帕鲁击杀,将这些帕鲁放出来后,可将这些帕鲁直接击杀,击杀后会获得这个帕鲁掉落的材料。这也是一个处理多余帕鲁的方法,而且还能获得一些材料,不会有所亏损。