在修好矿井后可以开始下矿,每次下矿都需要消耗一张矿井通行证,每天只能够在一二三层矿里选择一种。在下三层矿的时候,除了要消耗基础的一张矿井通行证之外,还要额外消耗四个绿宝石碎片。在晚上十二点时会出现剧毒,所以要提前离开,在十一点和十一点半会提醒一次,需要注意离开的时间。在下矿之前还要准备矿井内需要用到的东西,比如照明设备火把、矿工帽子选择一种,以及挖矿的工具镐子。
在矿井中还会出现动物,所以还要带攻击的武器,以及恢复生命的食物。要要带上旧钥匙,在任何一层矿洞都有密室,只不过每层矿洞的密室不太一样,三层矿也不例外,所以最好带上旧钥匙开启密室。准备一切东西后就可以下三层矿了,三层矿的矿石种类相较于前两层矿来说更少,只有两种可以开采的矿石,石头和铍矿,敲开熔岩柱来获得石头,小概率掉落化石,敲开铍矿石出铍矿。
三层的密室会更加复杂,有三种类型的密室,其中简单的一种类型是一字型的,另外一种是十字形的,最复杂的一种密室是十字形的其中一边延伸出L字形,在密室中需要稍微记忆防止迷路。与前两层矿不同的是,三层矿中会有大部分岩浆地形,触碰到岩浆会短时间内灼伤,需要用准备好的食物来应对。在三层矿里有红色的宝箱可以开启,里面能开出的资源相对前两层矿更加稀有和实用。