骷髅洞穴是位于沙漠地图的矿洞,这里的危险程度很高,要比鹈鹕镇矿井具备更多的挑战,想要在骷髅洞穴下到100层,必须要做好万全准备。骷髅洞穴开启有两个条件,第一要解锁沙漠地图,第二要拿到头骨钥匙。解锁沙漠地图必须修复巴士站,而修复巴士站也有两个方法,一个是在社区中心把金库收集包集满,一个是在joja超市中购买社区发展项目的公告汽车。头骨钥匙是首次打开鹈鹕镇矿井120层的宝箱获取。

和普通矿洞一样,骷髅洞穴冲层的方法也是在每层找出梯子,敲碎石头和击败怪物都有可能出现。和普通矿洞不一样的是,骷髅洞穴有时会出现洞口,跳下去可能随机掉落3-15层,不过会损失一定的生命值。但即使有可以快速冲层的洞窟,没有电梯存档的机制还是让大多数玩家头疼的一点,一旦离开骷髅洞穴,都要从第一层重新开始。更多的怪物种类,以及强力的属性,需要玩家带好装备和食物。
想要尽快到达骷髅洞穴100层,每周日在沙漠商人处用翡翠兑换楼梯则是最好的,自己也可以用石头制作楼梯,遇到怪物较多,或是地形狭窄且大的楼层,都可以直接用楼梯道具下去。佩戴拥有不同效果的饰品也是能减轻洞穴的难度,例如寒冰法杖,每隔几秒就会发射一个冰球冻结周边的敌人,仙女盒可以召唤一个仙女,为角色周期性的提供治疗。
由于骷髅洞穴每层都具备较大的面积,单靠十字镐是很难找到当前楼层的梯子,所以可大面积炸矿的炸弹就是必不可少的。炸弹的获取可以与矿井右侧的的矮人交易,也可以自己制作。在怪物方面不仅有被击倒后可重新站起来的木乃伊,还有对玩家造成极大伤害的飞蛇,银河剑、熔岩武士剑或者黑曜石之刃都是最基础的武器选择。每日通过算命占卜节目,选择运气高的一天前往,对于下矿也有着很大帮助。好运日能影响下矿生成楼梯、矿井的概率,在一些稀有矿物生成的数量上,也会受到运气影响。