据点防卫总动员玩法是布置炮台和机关,并结合元素反应击败不断出现的敌人,在进入对局之前先装备上两个支援技能,进入第一关后先在中间一列布置一个能量炮台并赋予火元素,然后在炮台的右侧布置一个机关陷阱并赋予水元素。当炮台等级为一级时攻击范围只有一格,因此刚开始不要直接在右侧布置炮台,不然无法攻击到全部敌人,本关开启时所有支援技能为满能量状态,使用后能加速击败敌人,仅靠炮台和机关也能击败第一波敌人。

第一波结束后在右侧布置第二个机关,将元素切换为雷元素,随后对另外一个炮台机关进行升级扩大攻击范围,不够的伤害能通过支援技能进行弥补。第二轮结束后继续对现有的两个炮台进行升级,之后在右上角布置一个新炮台,元素选择风元素,成功通关第三波后对现有的三个炮台进行升级,尽量都升到满级,三个满级炮台足以应对本关中的所有敌人。第一关最后出现的敌人是熔岩游像蚀土者,这个敌人保留了在大世界中的特性,受到多次火元素攻击后会自动瓦解。

第二关支援技选两个带有推荐标识的范围技能,可以给敌人挂上火元素或水元素,本关中新增了收集机关,能提升获得螺栓货币的概率,对局开场前场地已经默认有两个收集机关,可以选择进行升级提升螺栓收集数量。然后在怪物出口处布置两个炮台机关,分别赋予火元素和雷元素,在对局进行期间也能继续布设炮台,成功通关第一波后对现有炮台进行升级,首选提升杀伤范围,接着新放置一个收集机关,提升获得螺栓货币的效率。升级后的机关能轻松应对第二波敌人,成功通关后进入强化协议选择,需参考受益机关数量来选,最好选收益机关数量中不含零的选项,之后继续升级现有机关。

第三波会出现熔岩游像,可以提升火元素机关的攻击频率,相关资源足够的话能培养出两个满级炮台,通关第三波后继续在附近新建炮台,新建时采用风元素进一步扩展元素反应类型,同时将新建的炮台一次性提升到满级。第四波出现的敌人会带有冰元素护盾,火元素和雷元素都是高效破盾途径,再加上风元素扩散破盾效率会很高。最后一个出场的敌人是丘丘霜铠王,登场后它会开启冰元素护盾并提高自身抗性,需要尽快完成破盾,成功击败所有敌人后就能通过第二关挑战。